Detección de especies del género Mycobacterium
Wu X, Zhang J, Liang J, Lu Y, Li H, Li C et al. Comparison of three methods for rapid identification of micobacterial clinical isolates to the species level. J Clin Microbiol 2007; 45(6):1898-903.
Un nuevo ensayo de hibridación de dot blot PCR-reversa (RDBH) ha sido desarrollado para la identificación rápida de especies de Mycobacterium en aislamientos clínicos. El ensayo, que tiene como blanco al 16S ARNr, fue evaluado para 27 cepas de referencia micobacterianas y 340 aislamientos clínicos que fueron identificados simultáneamente por secuenciación de ADN y métodos convencionales, incluyendo las características de crecimiento, producción de pigmento, morfología de colonia y pruebas bioquímicas. Todas las cepas de referencia y los aislamientos clínicos hibridizaron para la sonda del género Mycobacterium (sonda M) en membrana (100% sensibilidad). Cada sonda tuvo sólo una señal de hibridación con la correspondiente especie o complejo de Mycobacterium (100% de especificidad). Comparado con la secuenciación de ADN, el ensayo de RDBH identificó correctamente 337 de los 340 aislamientos analizados (99,1% de exactitud). Un aislamiento de M. asia y uno de M. neoaurum no fueron identificados por el ensayo de RDBH debido a la ausencia de sondas específicas para las dos especies en membrana. Tres aislamientos con diferentes secuencias nucleotídicas de cepas de referencia de M. intracellulare tuvieron una señal de hibridación negativa con la sonda c, que es específica para M. intracellulare. El procedimiento total puede ser completado dentro de 2,5 h postprocesamiento de PCR. Un total de 32 de los 340 aislamientos fueron identificados erróneamente por métodos convencionales (90,6% de exactitud). La identificación molecular basada en la secuencia 16S ARNr fue superior a las propuestas convencionales en velocidad, sensibilidad y especificidad. Por lo tanto, el ensayo de RDBH puede ser considerado como un método rápido, simple y confiable para la identificación rutinaria de micobacterias de frecuente ocurrencia y relevancia clínica.
Bibliografía
En inglés
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